MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 75679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013851	GCA	2	6	172551	172556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939924
3502	NC_013851	GC	3	6	172563	172568	0 %	0 %	50 %	50 %	288939924
3503	NC_013851	TGCT	2	8	172571	172578	0 %	50 %	25 %	25 %	288939924
3504	NC_013851	CGA	2	6	172593	172598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939924
3505	NC_013851	GGC	2	6	172604	172609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939924
3506	NC_013851	GCG	2	6	172681	172686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939924
3507	NC_013851	TCT	2	6	172698	172703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939924
3508	NC_013851	TGC	2	6	172715	172720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939924
3509	NC_013851	CCT	2	6	172746	172751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939924
3510	NC_013851	GCC	2	6	172757	172762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939924
3511	NC_013851	GCCAG	2	10	172803	172812	20 %	0 %	40 %	40 %	288939924
3512	NC_013851	GTT	2	6	172905	172910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939925
3513	NC_013851	GCTC	2	8	172934	172941	0 %	25 %	25 %	50 %	288939925
3514	NC_013851	TCA	2	6	172976	172981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939925
3515	NC_013851	TCC	2	6	172987	172992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939925
3516	NC_013851	TCG	2	6	172999	173004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939925
3517	NC_013851	AGA	2	6	173024	173029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939925
3518	NC_013851	AAG	2	6	173104	173109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939925
3519	NC_013851	CGCA	2	8	173149	173156	25 %	0 %	25 %	50 %	288939925
3520	NC_013851	GCA	2	6	173201	173206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939925
3521	NC_013851	GCT	2	6	173246	173251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939925
3522	NC_013851	CGA	2	6	173318	173323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939925
3523	NC_013851	CAG	2	6	173352	173357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939925
3524	NC_013851	TGG	2	6	173423	173428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939925
3525	NC_013851	GTC	2	6	173442	173447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939925
3526	NC_013851	GCG	2	6	173454	173459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939925
3527	NC_013851	CTG	2	6	173502	173507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939925
3528	NC_013851	CTT	3	9	173520	173528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939925
3529	NC_013851	GC	3	6	173548	173553	0 %	0 %	50 %	50 %	288939925
3530	NC_013851	CGC	2	6	173594	173599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939925
3531	NC_013851	GCC	2	6	173646	173651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939925
3532	NC_013851	CGA	2	6	173675	173680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939925
3533	NC_013851	GGC	2	6	174014	174019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939926
3534	NC_013851	GCG	2	6	174035	174040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939926
3535	NC_013851	GAT	2	6	174086	174091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939926
3536	NC_013851	CGA	2	6	174094	174099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939926
3537	NC_013851	CGC	2	6	174118	174123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939926
3538	NC_013851	CTT	2	6	174143	174148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939926
3539	NC_013851	TCG	2	6	174153	174158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939926
3540	NC_013851	ACC	2	6	174231	174236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939926
3541	NC_013851	GCC	2	6	174237	174242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939926
3542	NC_013851	GCA	2	6	174259	174264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939926
3543	NC_013851	CGG	2	6	174283	174288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939926
3544	NC_013851	CGT	2	6	174319	174324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939926
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3547	NC_013851	AGT	2	6	174385	174390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939926
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3551	NC_013851	GCC	2	6	174617	174622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939926
3552	NC_013851	CCA	2	6	174635	174640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939926
3553	NC_013851	CGA	2	6	174646	174651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939926
3554	NC_013851	CGTC	2	8	174660	174667	0 %	25 %	25 %	50 %	288939926
3555	NC_013851	CGA	2	6	174670	174675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939926
3556	NC_013851	CCGA	2	8	174717	174724	25 %	0 %	25 %	50 %	288939926
3557	NC_013851	TCT	2	6	174754	174759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939926
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3560	NC_013851	AGCG	2	8	174786	174793	25 %	0 %	50 %	25 %	288939926
3561	NC_013851	AGA	2	6	174814	174819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939926
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3567	NC_013851	GGC	2	6	175142	175147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939926
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3569	NC_013851	GCG	2	6	175211	175216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939926
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3572	NC_013851	CGCC	2	8	175290	175297	0 %	0 %	25 %	75 %	288939926
3573	NC_013851	TGA	2	6	175318	175323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939926
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3602	NC_013851	GATC	2	8	176489	176496	25 %	25 %	25 %	25 %	288939927
3603	NC_013851	CAC	2	6	176511	176516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939927
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3605	NC_013851	CGGGC	2	10	176646	176655	0 %	0 %	60 %	40 %	288939927
3606	NC_013851	GC	3	6	176659	176664	0 %	0 %	50 %	50 %	288939927
3607	NC_013851	CCT	2	6	176793	176798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939928
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3986	NC_013851	GC	3	6	194653	194658	0 %	0 %	50 %	50 %	288939942
3987	NC_013851	TGCG	2	8	194774	194781	0 %	25 %	50 %	25 %	288939942
3988	NC_013851	GTT	2	6	194868	194873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939942
3989	NC_013851	TTGT	2	8	194880	194887	0 %	75 %	25 %	0 %	288939942
3990	NC_013851	AGC	2	6	194899	194904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939942
3991	NC_013851	TCA	2	6	194980	194985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939942
3992	NC_013851	TGC	2	6	194992	194997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939942
3993	NC_013851	CGG	2	6	195005	195010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939942
3994	NC_013851	GAA	2	6	195051	195056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939942
3995	NC_013851	GCG	2	6	195143	195148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939942
3996	NC_013851	CCTCGG	2	12	195179	195190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	288939942
3997	NC_013851	CG	3	6	195200	195205	0 %	0 %	50 %	50 %	288939942
3998	NC_013851	TTC	2	6	195307	195312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939942
3999	NC_013851	GGC	2	6	195329	195334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939942
4000	NC_013851	GCC	2	6	195367	195372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939942

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